ICU及其它各科ICU病房
ICU患者普遍存在自身免疫力低下、抵抗力差、易感性强、接受侵入性诊疗多、监护措施多、使用抗生素量大、时间长等特点，是医院感染的高危区。
手术室
完善层流技术、动态消毒灭菌、降低了层流屏的工作负载与缩短净化时间，并有效提高了它的寿命。
消毒供应室无菌区
消毒供应室在整个医院中的器械、敷料、一次性用品服务中都非常重要，为此消毒供应室内的空气消毒质量、效果与医院感染的控制密切相关。
血透室
血透室的透析患者因反复输血，在体外循环操作中接触和污染的机会多，加上免疫功能不全等容易引起感染，不仅给患者带来了痛苦，还增加了医疗费用和法律风险。
新生儿科
病人危重、小儿各系统发育不成熟、抵抗力差，易受病原体的侵袭，尤其是呼吸道和消化道感染。
产房、母婴室
母婴室是一个特殊的场所，无论是刚生产完的母亲还是刚出生的婴儿，这时候的免疫力是非常薄弱的，母婴的身状况都比较虚弱，母婴室是产科医院感染控制的重要部门之一。
血液洁净病房
血液病的患者出现医院感染一般都因为其自身免疫力功能下降，再加上一些化疗和一些免疫抑制药剂的使用使得患者自身机体的免疫力进一步地下降了，血液病患者属于医院感染高危人群，对患者的生活质量和身体健康都有十分严重的影响。
烧伤病房
烧伤重症患者引起烧伤全身性感染的致病菌重要的外源性来源是创面，术后大面积烧伤创口全暴露情况居多，病人免疫力非常低下，极易受到外部感染。
放、化疗病房
放、化疗对正常组织、骨髓、血液细胞造成破坏损伤，是患者免疫功能进一步降低，极易诱发医院感染的发生。
检验科、病理科
检验过程中产生的气溶胶都易污染空气．故有效的空气消毒及检验科微生物监测，对控制医院感染有重要意义。病理科使用的化学试剂量大,种类多,作用时间长,是医院里环境污染的重灾区。
各科换药室
换药室是相对无菌的地方，也是供给病人换药相对安全的地方。
消化内镜中心
消化内镜是一种侵入性操作，可能导致组织损伤，清洗消毒或者灭菌不彻底，空气环境不佳都极易引起院内感染。
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